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Robin Nunkesser


Addresse: Informatik 2, TU Dortmund, Otto-Hahn-Straße 14
44221 Dortmund, Deutschland
Büro: Otto-Hahn-Straße 14, Raum 333 
E-mail: Robin.Nunkessertu-dortmund.de
Telefon: +49 231-755-5132
Fax: +49 231-755-2047 
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Forschungsinteressen: Effiziente Algorithmen, Probleme der Statistik, Algorithmische Geometrie, Graphendarstellung

Software

RFrEAK ist eine Erweiterung von FrEAK für Probleme der Computationalen Statistik und R-Interaktion.
RFrEAK erweitert FrEAK um Suchräume namens "boolean functions" und "subsets of points", die in gleicher Weise benutzt werden können wie alle Suchräume, die im unten stehenden "User's Guide" beschrieben sind. Des Weiteren gibt es ein Button namens "Quick Start GPAS" (Genetic Programming for Association Studies) über das ein schnellerer Zugriff auf die Möglichkeiten des neuen Suchraums möglich ist.
Die Anbindung an R ist durch ein R Paket realisiert.

R Paket RFreak

Verfügbar im CRAN.

RFrEAK 0.2

R Paket rPorta

Verfügbar im CRAN.

Veröffentlichungen

  • Robin Nunkesser. RFreak - An R Package for Evolutionary Computation. Technical Report 12/2008, SFB 475, TU Dortmund, Germany.
    [Technical Report]
     
  • Oliver Morell, Thorsten Bernholt, Roland Fried, Joachim Kunert und Robin Nunkesser. An Evolutionary Algorithm for LTS-Regression: A Comparative Study. Compstat 2008. Akzeptiert.
     
  • Robin Nunkesser. Analysis of a Genetic Programming Algorithm for Association Studies. Proceedings of GECCO 2008. ACM, 1259-1266, 2008.
    [DOI link]   [Vortrag]
     
  • Robin Nunkesser und Philipp Woelfel. Representation of Graphs by OBDDs. Discrete Applied Mathematics. Akzeptiert.
    Konferenzversion: ISAAC 2005.
    [DOI link]  [Konferenzversion]  [Vortrag]
     
  • Robin Nunkesser, Roland Fried, Karen Schettlinger und Ursula Gather. Online Analysis of Time Series by the Qn Estimator. Computational Statistics & Data Analysis. Akzeptiert.
    [DOI link]
     
  • Robin Nunkesser, Karen Schettlinger und Roland Fried. Applying the Qn Estimator Online. In: Preisach, C., Burkhardt, H., Schmidt-Thieme, L., and Decker, R. (Eds.) Data Analysis, Machine Learning and Applications (Proceedings of GfKl 2007). Springer, 277-284, 2008.
    [DOI link]   [abstract]   [Vortrag]
     
  • Robin Nunkesser, Thorsten Bernholt, Holger Schwender, Katja Ickstadt und Ingo Wegener. Detecting High-Order Interactions of Single Nucleotide Polymorphisms Using Genetic Programming. Bioinformatics, 23(24):3280-3288, 2007.
    Vorversion: Technical Report 24/2007, SFB 475, Universität Dortmund, Germany.
    [abstract]   [article]   [Technical Report]
     
  • Thorsten Bernholt, Robin Nunkesser und Karen Schettlinger. Computing the Least Quartile Difference Estimator in the Plane. Computational Statistics & Data Analysis, 52(2):763-772, 2007.
    Vorversion: Technical Report 51/2005, SFB 475, Universität Dortmund, Germany.
    [DOI link]   [Technical Report]
     

Vorträge und Posterpräsentationen

  • Robin Nunkesser. A Genetic Programming Algorithm for Association Studies. Compstat 2008.
    [abstract] [Vortrag]
     
  • Robin Nunkesser, Silke Straatmann und Simone Wenzel. rPorta - An R Package for Analyzing Polytopes and Polyhedra. UseR! 2008.
    [abstract] [Vortrag]
     
  • Robin Nunkesser. Evolutionary Algorithms for Robust Methods. ERCIM and CFE 2008.
    [Vortrag]
     
  • Robin Nunkesser. RFreak - An R Package for Evolutionary Computation. Statistical Computing 2008.
    [abstract] [Vortrag]
     
  • Robin Nunkesser Genetic Programming for Association Studies. Seminarvortrag im Institut für Medizinische Biometrie, Informatik und Epidemiologie Bonn.
    [Vortrag]
     
  • Robin Nunkesser, Thorsten Bernholt, Oliver Morell und Holger Schwender. Evolutionary Computation for Problems in Computational Statistics. Statistical Computing 2007.
    [abstract] [Vortrag]
     
  • Robin Nunkesser, Karen Schettlinger, Roland Fried und Ursula Gather. Online Analysis of Time Series by the Qn Estimator. ERCIM WG and CFE 2007.
    [abstract] [Vortrag]
     
  • Oliver Morell, Thorsten Bernholt, Roland Fried, Joachim Kunert und Robin Nunkesser. An Evolutionary Algorithm for LTS-Regression: A Comparative Study. DAGStat Tagung 2007.
    [abstract] [Poster]
     
  • Thorsten Bernholt, Robin Nunkesser und Karen Schettlinger. New Algorithms for Least Quartile Difference Regression. Compstat 2006.
    [abstract] [Vortrag]
     
  • Thorsten Bernholt und Robin Nunkesser. Fast Algorithms for Robust Regression. Statistical Computing 2006.
    [abstract] [Vortrag]
     
  • Katja Ickstadt, Thorsten Bernholt, Arno Fritsch, Robin Nunkesser, Holger Schwender und Roland Fried. MCMC or Genetic Programming? Comparing Search Algorithms for the Analysis of Genotype Data. ISBA 2006.
    [Poster]
     

Arbeiten

  • Robin Nunkesser. Zur impliziten Darstellung von Graphen durch OBDDs.
    Diplomarbeit, Universität Dortmund (2004).
    [ps]  [pdf]  [BibTeX]  [Folien]  [Folien (neu)]
     

 Zuletzt geändert: 14.10.2008